根据相关资料显示,上方山地区共有维管束植物110科，319属，652种（野生植物种557、栽培植物种95)。其中木本植物105种，草本植物547种。

上方山植物种类基本上属于北极植物区的中国‒日本区系，少数属于中亚和西亚植物亚区，以及古热带植物区东南亚植物亚区。

据了解，上方山植被资源以侧柏、栎类天然次生林为主，由于属于石灰岩地区，喜钙或耐钙植物如青檀、朴树广为多见，尤其值得一提的是，上方山的阔叶混交林也有一定的面积，这个在北京甚至华北都极为罕见，具有原始的地带性植被特征。